【摘要】目的运用生物信息学方法分析GenBank中登录的4种龙胆目植物的5个查尔酮合成酶基因(CHS)。方法分别用ExPASy ProtParam Tool、Prot Scale和Mega等软件,对5个基因的理化性质、跨膜结构、蛋白质二级结构和三级结构及结构域进行了分析和预测,并利用距离矩阵方法中的邻接法构建CHS系统发育树。结果与结论龙胆目CHS基因编码区(CDS)的全长均为1 170 bp,大约编码389个氨基酸;其中只有华北白前的氨基酸序列预测结果是不稳定蛋白质,另外4个均为稳定的蛋白质;5个都是疏水性蛋白质;二级结构中主要结构元件是α螺旋和不规则卷曲;都具有查尔酮合成酶蛋白典型的结构域;利用同源建模的方法预测了三维结构,与预测的二级结构结果相一致;均无信号肽和跨膜结构。根据CHS蛋白的氨基酸序列对龙胆目及另外62种植物进行了系统分析,四种植物的氨基酸序列聚在一起,它们与唇形目和茄目的同源关系较近,得到的这些相关信息可以为之后进一步的研究奠定基础。
【关键词】
《建筑知识》 2015-05-12
《中国医疗管理科学》 2015-05-12
《中国医疗管理科学》 2015-05-12
《中国医疗管理科学》 2015-05-12
《重庆高教研究》 2015-06-26
《重庆高教研究》 2015-06-30
《广州大学学报（社会科学版）》 2015-07-01
《华侨大学学报（哲学社会科学版）》 2015-07-07
010-56259535
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